Po studiích na jezuitském gymnáziu v Tuřanech a pak v Brně nastoupil dráhu státního úředníka. Jeho kariéra vyvrcholila ve funkci zámeckého hejtmana v Mikulově, kde ve věku 64 let i zemřel.
F. J. Schwoy studoval jezuitské gymnasium v Tuřanech (dnes městská část Brna), pak v Brně. Poté nastoupil úřednickou dráhu, jejímž vrcholem bylo místo zámeckého hejtmana v Mikulově.