Magistrát města Chomutova poskytuje služby veřejné správy. V jeho kompetenci je agenda v rámci tzv. přenesené působnosti (vydávání osobních a cestovních dokladů, stavební povolení apod.) Poskytuje veškeré potřebné informace občanům.
Magistrát města Chomutova se nachází na šesti adresách. Na staré radnici na náměstí 1. máje 1 naleznete kanceláře primátora města i obou jeho náměstků. Dále zde působí odbory: odbor vnějších vztahů, odbor rozvoje a investic.