Ministerstvo zdravotnictví je ústřední orgán státní správy pro zdravotní péči. Ministerstvo provozuje Státní ústav pro kontrolu léčiv a Státní zdravotní ústav. Dále je v přímé působnosti ministerstva zdravotnictví Endokrinologický ústav, Masarykův onkologický ústav, Ústav zdravotnických informací.